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紅杉、啟明加持,AI制****新銳斬獲1億美元融資:火熱的AI能否破解GPCR研發難題?丨專家解讀

發布人:深科技 時間:2021-10-25 來源:工程師 發布文章
GPCR(G-protein-coupled receptors,G 蛋白偶聯受體)是****物開發領域的 “明星” 靶點家族,一直以來,被學術界和產業界追捧。但因其構象更為復雜,開發難度很大,開發 GPCR 也被視為業內公認難啃的 “硬骨頭”。近年來,業界決定采取多種方法破解這些難題,5 年前 GPCR 先驅 Raymond Stevens 決定利用計算和 AI 方式解析 GPCR。


美東時間 10 月 20 日,AI 制****公司碩迪生物(ShouTi Inc.)宣布完成 1 億美元 B 輪融資并正式走出隱匿模式。本輪融資由 BVF Partners L.P. 領投,Casdin Capital、TCG X、禮來亞洲基金、Surveyor Capital 等跟投,現有投資方啟明創投、紅杉資本中國、****明康德等持續加注。碩迪生物表示,所籌集的資金將用于推進其****物發現平臺和臨床階段在研管線的持續開發。
該公司是一家位于上海的 AI 制****初創,成立于 2016 年,與 AI 制**** “老兵” 薛定諤淵源頗深。該公司由 Raymond Stevens 與薛定諤聯合創始人 Rich Friesner 共同創辦,并與薛定諤達成了合作。完成本輪融資后,碩迪生物的總融資金額達到了 1.58 億美元。

“過去 20 年,生物制****和多肽****物飛速發展,計算預測和實驗方法方面也取得了長足的進步。現在,碩迪生物將這些前沿科學技術結合在一起,以開發出療效更好的口服小分子****物。” 碩迪生物聯合創始人兼首席執行官 Raymond Stevens 博士說。
從公開資料來看,碩迪生物主要的業務是做****物設計,包括設計****物分子、優化****物分子結構、預測****物分子毒性等問題。” 一位長期從事計算****物設計工作的業內人士告訴生輝。與薛定諤聯創成立,已建 3 條管線


創始人 Raymond Stevens 是斯克利普斯研究所分子生物學和化學教授,也是上海科技大學 iHuman 研究所的創始主任。他是高通量結構****物發現領域的先驅人物,2007 年,他曾與斯坦福大學醫學院分子與細胞生理學教授 Brian K. Kobilka 共同解析了第一個非視紫紅質 GPCR 晶體結構 —— 人 β2 腎上腺素受體,這是第一個人 GPCR 高分辨率結構的研究。
同時他也是連續創業者,1998 年,Raymond Stevens 創辦基于結構的高通量****物發現公司 Syrrx,專注于 GPCR ****物研發,該公司開發了 2 型糖尿病****物 Nesina?,后被武田約 2.7 億美元收購;2008 年,他創辦了 GPCR 新****研發公司 Receptos,并搭建了 GPCR ****物發現平臺。2015 年,新基(現為 BMS)斥資 72 億美元收購了 Receptos,包括旗下的候選**** Zeposia?(Ozanimod)。

彼時,真正讓新基一擲千金的是 Zeposia?,這是一種 GPCR 靶向****物 ——S1P1 激動劑,已經相繼獲批用于治療多發性硬化癥和潰瘍性結腸炎。S1P(1 - 磷酸鞘氨醇)通過與 S1PR(受體 1 - 磷酸鞘氨醇受體)結合在不同細胞中發揮作用,也被視為自身免疫疾病、心血管疾病、神經系統疾病、炎癥、腫瘤等多種疾病的熱門靶點。
“當 Receptos 被收購時,其平臺運行良好,不過新基只想要資產 Zeposia?。因此,我們看到了在斯克利普斯學術機構內部繼續推進平臺的機會。”Raymond Stevens 說。
也正是出于對平臺技術的看好,他決定與昔日好友、薛定諤聯合創始人 Rich Friesner 共同進一步開發 GPCR ****物發現平臺。他們于 2017 年創辦碩迪生物,專注于開發用于治療慢性病的口服小分子****物。


官網顯示,碩迪生物正在搭建****物發現平臺 —— 結合了計算化學、結構生物學和大規模數據集專業知識,產品管線聚焦于心血管、代謝和肺部疾病三大領域。
“如果能夠弄清楚這些膜受體的結構,就有可能開發出克服生物制劑和肽療法局限性的小分子****物。我們真正了解了 GPCR 的功能,而且對****理學了解非常深入”,Raymond Stevens 對外媒說,“我認為理解可能是我們最大的優勢之一。”
公開資料顯示,其****物發現和開發引擎建立在生成膜蛋白結構領域超 20 年的創新基礎之上,尤其是 GPCR,這類靶點是基于結構****物發現方式最具挑戰性的靶點之一。碩迪生物正在基于高分辨率結構更好地理解和調節****理功能,據悉該平臺可以將生物制劑和多肽療法轉化為口服小分子****物,同時提高生物利用度和穩定性。


現在,該公司擁有 50 名員工和 3 條管線,其中第一條用于治療肺動脈高壓(PAH)的管線已經進入臨床。Raymond Stevens 在接受采訪時表示,他們計劃明年初之前在澳大利亞完成該候選****物的 I 期研究,II 期研究可能會在美國市場進行。PAH 是一種高危疾病,多項國際注冊登記研究中關于 PAH 的流行病學數據顯示,成人 PAH 發病率約為 2.4 / 百萬人年,患病率約 15 / 百萬。
據 Raymond Stevens 介紹,其第二條管線將于明年進入臨床階段,第三條管線處于早期開發階段,目前該公司暫未披露靶點細節。AI 能否助力突破 GPCR 研發難題?


GPCR 是人體內最大的細胞膜表面受體家族,大約有 800 多個家族成員,與癌癥、糖尿病、神經等多種重大疾病密切相關。目前,研究人員認為 GPCR 是最理想的****物靶點之一,大約 34% 小分子****物能夠與 GPCR 結合。在過去 5 年里,已有 41 種靶向 GPCR 的****物獲 FDA 批準上市,占到了同期批準****物總數的 19%。
GPCR 靶點具有很大的潛力與臨床意義,市場上通過 FDA 審批的****物中有近 40% 靶向 GPCR,銷售總額占全球市場的 27%,涉及許多熱門的治療領域。” 晶泰科技聯合創始人賴力鵬說。
然而,GPCR 是一種七次跨膜蛋白,構象更復雜,控制諸多下游通路,要想真正挖掘 GPCR 靶點絕非易事。目前看來,GPCR 靶點開發還有很多難點有待解決。
賴力鵬告訴生輝,針對 GPCR 的新****研發存在幾大難點:首先是,GPCR 靶點結構不穩定、低表達,導致部分蛋白比較難獲取,GPCR 膜蛋白的膜上的結構也比較難確定。目前,只有一小部分 GPCR 靶點結構已知,難以基于結構進行****物篩選;此外,需要進行細致的分子設計、對 GPCR 的功能進行準確的調控,這對研發技術的要求更高。
“長久以來,GPCR 一直是熱門明星靶點,近 40% ****物針對 GPCR 靶點。不過其難點在于****物分子的測活技術,目前沒有很好的手段和方法去表其活性。生物測活的表征是 GPCR 類****物研發中最關鍵的問題,而這其實取決于 GPCR 生物芯片的開發,現在需要在生物芯片技術領域有所突破。” 中國科學院深圳先進技術研究院研究員袁曙光說。
具體來說,GPCR 在整個人體分布很廣泛,人體幾乎各種疾病其實都與 GPCR 直接相關,或與其信號通路相關。但是,GPCR 屬于膜蛋白,它在分子活性測試表征上有很多技術瓶頸,包括分子何時與其結合,何時解離。此外,****物分子激活 GPCR 之后,其下游可以激活不同的信號通路,現在還沒有很成熟的方法去表征下游能夠激活哪些信號通路。
除了利用傳統方式以外,初涉新****研發領域的 AI 也開始挖掘 GPCR 靶點,比如說,晶泰科技、阿爾法分子等利用 AI 進行 GPCR ****物開發。
那么,AI 能否破解 GPCR ****物研發難題?
袁曙光認為,****物分子測活是實驗問題,AI 難以突破實驗技術。其實現在****物分子測活方式還比較少,無論是在技術研究上,還是在產業轉化上,分子測活一直困擾著 GPCR 新****研發。此外,GPCR 新****研發的技術瓶頸還有很多,很難說可以通過 AI 或者計算的方法去回答這些問題。
“目前,AI、計算模擬、以及冷凍電鏡等實驗技術在 GPCR 及配體的相關研究中都已經有不少進展,晶泰科技有多項圍繞 GPCR 進行的合作研究。AI 結合計算模擬和實驗有機會實現以更高效率解析蛋白結構,進行包括小分子、多肽、抗體等不同種類的高效的分子設計。” 賴力鵬補充道。
參考資料:https://www.businesswire.com/news/home/20211020005305/en/ShouTi-Secures-100-Million-Series-B-Financing-to-Accelerate-Development-of-Life-Changing-Medicines-Fueled-by-Advanced-Computational-Structure-Based-Drug-Design-Platform


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