由于2009年關于IC卡加密破解的難題被攻破，國家信息產業部發布相關信息，對于日后門禁系統及一卡通系統在關鍵部門和機關禁止使用IC卡作為識別卡、計費卡。因此，眾多門禁廠家紛紛改變原有的設計，主要是采用了CPU卡讀卡器和相應的CPU卡，并重新做了加密解密的算法。一些廠家考慮了IC卡和CPU卡的兼容性難題，也在設計相應的軟件來實現兼容，但讀卡器硬件兼容的難題，目前仍在研發中，兼容的軟件相對容易實現。

門禁系統最重要的是防范加密卡破解，識別和控制相對是比較容易做到的，因此對于卡的性能是十分關鍵的。采用何種卡，就要相應的采用不同的硬件標準來匹配，同時各個公司在采用的卡里面設計自己的加密算法，也是該公司技術的核心，如何具備一套既可靠又穩妥的軟硬件技術是門禁廠家的關鍵點。

隨著計算機技術的高速發展，目前新開發的門禁系統全部使用了高性能的處理芯片，如ARM9、ARM7系列芯片，且采用基于TCP/IP技術，前端讀卡器多采用目前安全性最高的CPU讀卡器和CPU卡，但這只是目前短時期的技術發展方向。魔刀一尺，道高一丈，無論采取如何可靠的加密卡，都會有被破解的幾率，只是時間和成本的問題了，但隨著科技手段的提高，破解的成本和時間是越來越低。因此，安全性的提高只有是基于生物技術的發展才可以最終解決破解加密的難題。采用活體指紋技術，靜脈圖像識別技術，人臉識別技術，虹膜識別技術，DNA識別技術等，甚至是幾種生物識別技術都聯合在一起運用的門禁系統才是最終的技術發展方向。雖然現在已有這樣的門禁系統，但成本很高，因此降低生物識別傳感器的成本和提高識別的技術是今后主要的技術難點。這里面包含數學、生物、物理、傳感、光學、計算機等多種高科技手段，只有聯合開發才可以實現。