目前燃料電池依其電解質的種類，可以區分為堿液型(AFC, Alkaline Fuel Cell)、磷酸型(PAFC, Phosphoric Acid Fuel Cell)、溶解碳酸鹽型(MCFC, Molten Carbonate Fuel Cell)、固體氧化物型(SOFC, Solid Oxide Fuel Cell)、質子交換膜型，其中堿液型燃料電池以堿性溶液做為電解質，只能應用于純氫與純氧的操作條件，早年應用在航天設備電力系統，磷酸型燃料電池以濃磷酸溶液為電解質，其運轉溫度約200℃，溶解碳酸鹽型燃料電池作動溫度達650℃，固體氧化物型燃料電池運轉溫度為1,000℃，熱沖擊(Thermal shock)大。
質子交換膜型燃料電池(Proton Exchange Membrane Fuel Cell , PEMFC)屬于二次電池，是一種電化學裝置，以氫氣與氧氣反應的化學作用直接產生電力，不似內燃引擎的實際燃燒動作及產生廢氣排放。典型的燃料電池系統系藉由氫氣燃料與氧氣（來自空氣）在電池內產生的電化學反應，除提供電力外，其副產物是廢熱（電化學放熱反應及水排放），燃料電池不同于一般的二次電池，無需充電，只要能適度提供燃料(如氫氣或甲醇重組等)及空氣，即可持續產生電力。質子交換膜型燃料電池的電流密度可達數mA~A/cm2，質子交換膜型燃料電池因具極低污染、高效率、常溫作動(80℃以下)、快速激活優點，適合車輛動力需求，近年來逐漸朝可攜帶式(Portable)或靜置型(Stationary)電力，未來極可能是低污染交通載具（巴士、汽車、機車或小型電動車輛）動力的主流。

二、質子交換膜型燃料電池關鍵零組件技術研發與課題

1)提升燃料電堆性能
提升燃料電堆(Fuel Cell Stack)功率輸出密度，延長耐久性(汽車需能耐久5,000小時以上、且激活‧停止次數3~6萬次/10年，質子交換膜的耐高溫性‧低加濕化(Humidification)‧無加濕化‧減少白金被覆量(Coating load)‧開發白金替代觸媒‧分隔板(Separator)輕量化‧薄型化設計等。
2)燃料供應重組器
提升耐久性、延長循環壽命、提升激活性能與反應性、小型化/輕量化、汽車用汽油重組器開發。
3)燃料供應儲氫技術
以車輛可以行駛500km續航距離為例，研發可以儲存5kg氫氣的儲存技術，有以下實施方法
>高壓儲氫:~70Mpa(10,000psig)高壓儲氫筒(目前使用方式，儲氫筒強度問題)
>液態氫氣:蒸發氫氣防漏失(Boil-off gas)對策
>儲氫材料: 儲氫合金(Metal hydride)、化學儲氫材料、奈米碳管(Carbon Nano Tube , CNT)或碳儲氫材料
4)燃料電池系統
燃料電池系統構造最佳化設計，耐久性，低溫對策，激活性，運轉負荷反應性，提升廢熱回收效率，提升副機效率等。
5)氫氣燃料安全、氫氣供應體系(Infrastructure)周邊技術
氫氣壓縮機、電磁閥、高壓儲氫器與氫氣供應體系仍然不足，氫氣安全法規訂定、氫氣供應體系周邊技術待建立。