質子交換膜燃料電池以磺酸型質子交換膜為固體電解質,無電解質腐蝕問題，能量轉換效率高，無污染，可室溫快速啟動。質子交換膜燃料電池在固定電站、電動車、軍用特種電源、可移動電源等方面都有廣闊的應用前景，尤其是電動車的最佳驅動電源。它已成功地用于載人的公共汽車和奔馳轎車上。

工作原理如下：
燃料電池工程中心制備和小批量生產PEMFC的Pt/C 、Pt-Ru/C電催化劑、電極、膜電極三合一(EMAS)和電池雙極板等關鍵組件；研制和生產各種規格的電池組；進行PEMFC 電動車裝車試驗并研制以PEMFC為動力的電動車發動機。已掌握了一系列PEMFC 的關鍵技術，申請了十四項國家發明專利。成功地研制出100W ～5KW的各種規格的電池組, 電池額定輸出功率密度≥0.35W/cm2 。目前千瓦級PEMFC技術已經成熟，具備了商業開發的條件，同時在質子交換膜燃料電池氫源開發方面取得了重大進展。